Dans l'absolu c'est possible. Dans la pratique ça va être une usine à gaz à rédiger ça. Vous allez détailler les 2 procédures (AOO, MAPA), etc. ? ...
Je ne suis pas certain du tout que les formulaires permettent d'avoir des procédures différentes selon les lots.
Une solution simple : appliquer au petit lot la même procédure que pour le lot le plus important.